善心寺の由緒

寛永8年（1631年）に、大河内善兵衛政勝によって麻布日ケ窪（現在の東京都港区六本木）に創建される。開山は守慶院日栄上人（寛文2年5月29日没）。大河内政勝の母は、法華経篤信の大久保忠員の娘であり、大久保忠世、大久保忠佐、大久保忠為、大久保忠長、大久保忠教とは兄妹に当たる。善心寺の名前は大河内政勝の戒名である善心院殿日浄居士（寛永17年6月24日没）に由来する。大河内善兵衛政勝は実子はおらず、大久保彦左衛門忠教の四男である大八郎（のち善兵衛)政雄が大河内家の養子となる。

第2世寿要院日住上人（元禄9年11月3日没）の代の延宝年間（伝　延宝6年）に、大久保八良左衛門忠隆（大久保忠教の孫）により、大久保家の下屋敷があった大塚の現在地を寄進されて移転。元禄10年10月17日（1697年）には小日向・牛込・番町・麹町一帯を焼く火災（元禄の大火と呼ばれる火災のひとつ）の火元となった。

以後、大久保氏などの庇護を受けつつ諸堂が整備された。

第19世融妙院日完上人（慶応4年1月17日没）在住中の嘉永元年（1848年）には、火事で類焼した。日完上人は、幕府の要人と多く交流があり、消失前の書院は二階建てで、老中の会議がしばしば行われていたと伝えられる。翌嘉永2年（1849年）、本堂・庫裏を再建する。日完上人はその後関東本山格である丸山（現在は巣鴨に移転）本妙寺に晋山した。

大塚の地は江戸時代には閑静な別荘地帯であったが、小高い尾根（現　春日通り）沿いにあったこの寺からは、富士山が眺められる素晴らしい景観であったと伝えられている（境内地に並行する坂に富士見坂の別称あり）。大塚に移転した当初より、本堂は西向きで坂下通りに山門があり、坂の中腹の本堂を参詣していたが、幕末に至り現在の山門前の春日通りが本通りになったため、本堂を東向きに改めた。

第26世大悟院日襄上人（昭和57年4月30日没）の時代に納牌堂を建立する。